Campylobactérioses alimentaires

Abstract

La campylobactériose est une affection bactérienne due principalement à Campylobacter jejuni. Les Campylobacter sont des bactéries qui se trouvent partout dans l’environnement et qui font partie de la flore intestinale normale des mammifères et des oiseaux. La résistance aux antibiotiques, est due à leur usage abusif dans les productions avicoles ou autres, ce qui procure à Campylobacter une résistance de plus en plus élevée aux différents antimicrobiens La première partie de la thèse a porté sur : • Microbiologie animale : deux enquêtes ont été menées au niveau de deux bâtiments de poulailler, à des âges différents des poussins/poules. L’isolement de C. coli lors de la 1ère enquête à des âges très bas des poussins nous pousse à croire qu’il s’agit d’une contamination, d’autant plus que C. coli disparait avec l’apparition de C. jejuni. • Microbiologie alimentaire : A partir des 109 échantillons analysés, provenant de rôtisseries, 3 souches appartenant à Campylobacter jejuni ont été isolées à partir de prélèvements crus (2,75%). • Microbiologie humaine : A partir des 4309 échantillons de coproculture analysés, 92 souches de Campylobacter ont été isolées dont 66 appartiennent à Campylobacter jejuni (72%). Une prédominance masculine est observée pour toutes les tranches d’âge. Plus de la moitié des souches est isolée durant la période fin automne, début hiver. D’une manière globale, les Campylobacter issus des prélèvements animaux et alimentaires présentaient des taux de résistance plus élevés par rapport à ceux isolés des coprocultures. La résistance la plus importante a été observée d’une manière générale, pour les quinolones (jusqu’à 100%), les β-lactamines (81%), la tétracycline (près de 60%), l’érythromycine et le métronidazole (près de 52% pour les deux derniers). La seconde partie a concerné l’étude génétique de l’antibiorésistance. L’identification biochimique des Campylobacter au laboratoire a été confirmée par PCR. La détection de la résistance aux macrolides et aux quinolones chez Campylobacter a été réalisée par séquençage des gènes. L’alignement des séquences obtenues avec des séquences de référence a conduit aux résultats suivants : • La même mutation A2075G responsable de la résistance aux macrolides, a été observée pour toutes les séquences d’ADN étudiées pour C. jejuni et C. coli, qu’elles soient d’origine animale ou humaine, par rapport au type sauvage. Toutes les souches étudiées présentaient une résistance phénotypique aux macrolides. • Pour la résistance aux quinolones, toutes les séquences d’ADN de Campylobacter jejuni, et C. coli présentent une mutation C257T qui correspond à la mutation thréonine-à-isoleucine de l’acide aminé 86 de la GyrA. La troisième partie de cette étude a porté sur l’activité antibactérienne de quelques huiles essentielles sur Campylobacter. 17 huiles essentielles ont été testées sur des souches de Campylobacter et les activités inhibitrices les plus importantes ont été observées avec les huiles essentielles de clou de girofle, de thym et d’origan. Le pouvoir bactéricide est beaucoup plus accentué avec l’HE de thym. Cette étude montre l’efficacité de l’action antibactérienne des huiles essentielles sur le Campylobacter, notamment celles du thym de l’origan et du clou de girofle. L’utilisation de ces huiles permet de proposer une alternative aux antibiotiques, d’autant plus qu’elles présentent en général plusieurs vertus. Les résultats de ces travaux soulignent bien les risques que peuvent engendrer les contaminations par Campylobacter et l’utilisation massive et non réglementée des antibiotiques dans les élevages. Ce qui peut se répercuter directement sur la santé humaine au vu des entraves de traitements des intoxications alimentaires. D’où l’urgence d’une prise de conscience raisonnable.