Étude de la diversité génétique, de la pathogénicité et du potentiel toxinogène de Fusarium culmorum (Wm.G. Smith) Sacc. agent de la pourriture racinaire et de la fusariose de l’épi du blé en Algérie

Abstract

La fusariose de l‟épi et la pourriture du collet du blé sont des maladies fongiques qui sévissent à travers le monde engendrant des pertes sur les rendements considérables. Les espèces de Fusarium qui sont leurs principaux agents causaux produisent des mycotoxines dangereuses à la santé humaine et animale. Les prospections des zones de production du blé réalisées en 2014 et en 2015 ont confir-mé que F. culmorum est l‟espèce dominante en Algérie. Pour une étude globale des types sexuels, des chémotypes et de la structure génétique, la collection algérienne a été complétée par d‟autres originaires d'Italie, d‟Australie et des États-Unis. Les amplifications par PCR ont révélé que les deux types sexuels de F. culmorum coexistent en Algérie et dans les 3 autres pays. L‟identification des chémotypes des isolats de F. culmorum par ASO PCR a montré que le 3ADON est le chémotype prédominant dans les quatre pays. La quantification par GC-MS des toxines produites par les isolats algériens in vitro a confirmé les résultats de la ASO PCR et elle a également montré que la majorité des isolats testés ont coproduits le 3ADON ou le NIV et la culmorine. La diversité génétique de 182 souches de F. culmorum a été évaluée à l'aide de 9 marqueurs SSR. L'AMOVA révèle que 89% de la variation génétique était à l‟intérieur des populations. L'analyse bayésienne des données SSR a iden-tifié deux populations de distribution mondiale dans lesquelles les deux chémotypes et mating types étaient représentés. De plus, il a été noté que l‟optimum de croissance mycélienne des isolats algé-riens est situé entre 20°C et 25°C. L‟agressivité de ces isolats a été testée sur collet et sur épi des va-riétés de blé Vitron (blé dur) et HD 1220 (blé tendre), les résultats ont révélé l‟existence d‟une varia-bilité dans l‟agressivité entre les isolats de F. culmorum. Ainsi la variété HD 1220 s‟est avérée plus résistante que la variété Vitron.