Etude des populations de Botrytis cinerea agent de la pourriture grise et contribution à l’amélioration des méthodes de lutte alternatives

Abstract

La pourriture grise causée par Botrytis cinerea, est une maladie très redoutable en méditerranée, les conditions climatiques semblent être propice pour le développement de cette maladie. La complexité de la lutte chimique nous a incité à chercher des souches de Trichoderma efficace en lutte biologique. Dans cette étude, 73 isolats de B. cinerea ont été isolés à partir des cultures de Tomates, Vignes, fraisiers, fèves et courgette. La caractérisation phénotypique, l’étude de la pathogénicité et la sensibilité au fenhexamid ont été réalisés sur l’ensemble des isolats de B. cinerea. Trois isolats les plus virulents ont été choisis pour les différents tests de biocontrôle (BCV02, BCT04 et BCFr10). 15 isolats de Trichodermaspp. ont été isolés et identifiées commeT. afroharzianum(04 isolats),T. gamsii (04 isolats), T. longibrachiatum (03 isolats),T. atroviride(01 isolat), T. brevicompactum (01 isolat), T. breve (01 isolat) et T. lixii (01 isolat) sur la base des séquences des gènes ITS, tef1, rpb2 et acl1. Ce travail a fait l’objet d’une signalisation de 3 nouvelles espèces de Trichoderma pour la première fois en Algérie à savoir :T. brevicompactum, T. breve et T. lixii.Les différents tests de biocontrôlein vitro ont révélé de grandes capacités antagonistes chez certains isolats algériens contre B. cinerea.Les souches de Trichodermaspp. ont inhibé considérablement la croissance mycélienne des trois isolats de B. cinerea par rapport aux témoins. Les meilleurs résultats d’inhibition en confrontation directe ont été enregistrés chez les souches TGS7 (62,27 ± 2,75%), TAtC11(61,97 ± 2,27 %), TAS8 (61,60 ± 1,94) et TGS10 (61,36 ± 2,07).Les substances volatiles produites par les souches TGS7 (T. gamsii) et TAtC11 (T. atroviride), ont réduit la croissance mycélienne de 64,49 % et de 62,31 %, respectivement.Les meilleurs pourcentages d’inhibition ont été enregistrés chez les filtrats de culture de l’isolat TBS1 (T. brevicompactum) avec une moyenne de 90,68 % et de l’isolat TAtC11 (T. atroviride) avec une moyenne de 68,72 % d’inhibition, suggérant un fort effet antifongique des filtrats de ces deux isolats. L’étude de l’effet des isolats de Trichodermaspp. sur les graines de tomate a été réalisée en utilisant trois méthodes à savoir le traitement des graines par une suspension de spores, par composés volatiles et par les filtrats de culture des isolats de Trichoderma. Le pourcentage de germination et l’indice de vigueur ont été calculés pour chaque test. Les meilleurs résultats ont été observés chez :i) les isolats TAS2 et TBS1avec un indice de vigueur de 6520 et 4943, respectivement, pour le test des grainestraitées par une suspension de spores. ii) Les isolats TLS6, TAS5, TLC4 et TAS4 ont montré un indice de vigueur supérieur à celui du témoin dans le cas du test des graines traités par les composés volatiles. iii) Les isolats TBS1 et TAS4 avec un indice de vigueur supérieur à celui du témoindans le cas du test des graines traités par les filtrats de culture. Les essais de biocontrôle in planta réalisées sur des plants de tomate avec les suspensions de spores de T. brevicompactum (TBS1), T. atroviride (TAtC11) et T. lixii (TLiC8) et l’isolat BCT04 de B. cinerea ont montré que T. brevicompactum a réduit l’incidence de la maladie de 64,43 ± 4,34 % en traitement préventif et de 51,35 ± 1,56 % en curatif. Ce qui révèle que l’isolat TBS1 de l’espèce T. brevicompactum peut être préconisé pour la lutte biologique contre la pourriture grise de la tomate.