Etude scientifiqque,, techniqque et économiqque ppour la mise en place d’une souchethèque microbienne à l’ENSA

Abstract

Les collections de cultures et les centres de ressource biologiques sont le meilleur moyen pour préserver et pour cataloguer les microorganismes d’intérêt. Elles veillent à identifier, cultiver, maintenir et distribuer les ressources microbiennes aux différents chercheurs et industriels. A l’heure actuelle, l’Algérie ne possède pas une collection de cultures de microorganismes. L’objectif de notre travail est d’étudier les aspects scientifiques, techniques et économiques pour la mise en place d’une plateforme technique, nommée « Souchethèque » (Collection de Cultures de Microorganismes) à l’ENSA. Une enquête a été réalisée et elle a permis de récolter 127 réponses de spécialistes du domaine dont 13 enseignants de l’ENSA. Les bactéries (85,53 %) et Champignons (60,4 %) sont les deux groupes de microorganismes que les répondants souhaitent acquérir et/ou déposer à l’ENSA. La plupart des répondants (67,90 %) s’intéressent aux services de l’identification moléculaire. En effet, 94,8 % des répondants n’ont pas accès aux outils d’identification moléculaire. 60,4 % des répondants s’intéressent à la préservation et la maintenance des souches. La majorité des répondants (96,4 %) sont favorables à procurer les souches à partir d'une souchethèque locale à l’ENSA. L’étude scientifique et technique montre que la souchethèque de l’ENSA, doit se dotée de deux plateformes d’identification. Une plateforme moléculaire, formée d’une unité de Séquençage de technologie SANGER et une unité de Séquençage de nouvelle génération (NGS), et une deuxième plateforme métabolomique, équipée d’un spectrophotomètre MALDI-TOF-MS. A ces deux se rajoute une unité de culture et de conservation de niveau de sécurité II. L’analyse SWOT a montré que le choix de l’ENSA comme lieu pour la mise en place de la souchethèque est convenable car elle possède un capital humain et intellectuel important, avec une localisation géographique stratégique.