Résumé:
La pomme de terre (Solanum tuberosum L.) et la tomate (S. lycopersicum L.) sont deux cultures
solanacées importantes en Algérie. Elles sont réparties différemment dans les différentes zones
bioclimatiques du pays et sont conduites selon les différentes pratiques culturelles. Les cultures de
pommes de terre occupent des superficies importantes dans plusieurs régions du nord (Ain Defla) au
sud (El Oued) et de l’est (Skikda, Guelma) à l’ouest (Mostaganem, Mascara). Au contraire, la tomate est
principalement cultivée dans le nord de l’Algérie sur de plus petites surfaces et le plus souvent sous abri
plastique comme dans la région de Biskra. Les deux cultures sont souvent cultivées côte à côte ou même
en succession dans de nombreuses régions côtières du pays pendant plusieurs années. L’intensification
de ces deux cultures sans respect des bonnes pratiques agricoles a conduit au développement de maladies
importantes comme l alternariose.
La présente étude étaient, d’identifier au niveau de l’espèce les isolats d’Alternaria à grandes spores
obtenus par des prospections réalisées pendant trois années de culture (2012 2015) sur différents
champs de pommes de terre et de tomates dans les principales zones bioclimatiques d’Algérie. Comme
les symptômes d alternariose et les caractéristiques morphologiques des isolats ne permettent pas
d’établir une distinction nette entre les différentes espèces d’Alternaria à grandes spores, l’identification
spécifique des isolats a été basée sur la PCR en utilisant des amorces spécifiques, la PCR/RFLP par
double digestion enzymatique d’une portion du gène calmoduline et l’analyse de séquence aux gènes
calmoduline et RPB2. Cette étude était egalement menée pour évaluer l’agressivité des isolats sur leurs
hôtes respectifs de pomme de terre et de tomate, et de clarifier la spécialisation parasitaire des espèces
Alternaria à grandes spores par inoculations croisées artificielles in vitro et dans des conditions
similaires à celles du terrain. Enfin nous nous sommes intéressés à l étude de la diversité génétique des
populations d A.solani en utilisant pour une première fois des marqueurs moléculaires microsatellites.
Comme moyens de lutte contre l alternariose, une analyse des matières actives actuellement utilisées
par nos agriculteurs a été aussi effectuée afin de vérifier les niveaux l efficacité et la présence éventuelle
de souches résistantes.
