Browsing by Author "DEBBI, Ali"

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    Etude de la diversité génétique de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici agent du flétrissement de la tomate et recherche de l'effet antagoniste de Trichoderma spp. à l'égard de l'agent pathogène
    (2019-07) DEBBI, Ali
    Des prospections ont été menées dans différentes zones de production de la tomate en Algérie entre 2012 et 2015. 50 isolats de Fusarium associés à la culture de la tomate ont été collectés à partir de plants malades. Une caractérisation moléculaire par PCR en utilisant l'amorce spécifique PF02-03, a permis d'identifier 29 isolats comme étant des Fusarium oxysporum. En outre, l'amplification par PCR avec les amorces spécifiques P12-F2B / P12-R1, SIX3-F1/SIX3-R2, SIX4-F1/SIX4-R1 et SIX3-G137C-F1/SIX3-R2 a fait la distinction entre les isolats de Fol, et ceux du Forl, permettant l'identification de 19 isolats sur 29, comme Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (Fol), à savoir, 17 isolats comme race 2 (race dominante), 2 isolats comme race 3 et aucun des isolats n’a été identifié comme race 1. En outre, le test de pathogénicité in vivo a montré une grande diversité en terme d'indice de maladie allant de 1,2 à 3,7 enregistrés par les isolats F9 (Forl) et F30 (Fol) respectivement. L’étude de la diversité des isolats par les marqueurs ISSR, montrent une grande variabilité génétique aussi bien au sein des isolats de la même race qu'entre des isolats appartenant à des races différentes. Les résultats ont montré que seulement 10 isolats tendent à se regrouper par paire d'isolats avec un indice de similarité supérieur à 0,55. Le reste des isolats montrent un indice de similarité inférieur à 0,5. Cependant, une corrélation pourrait être notée entre le test de virulence et de la caractérisation moléculaire en utilisant des amorces spécifiques. Afin d'améliorer les méthodes de lutte biologique contre la fusariose de la tomate, trois espèces différentes, à savoir Trichoderma asperellum, T. harzianum et T. ghanense, ont été identifiées parmi une collection de 17 isolats autochtones de Trichoderma. Il est à noter que T. ghanense n'a jamais été signalé en Algérie auparavant. Bien que T8 (T. ghanense) ait enregistré les valeurs d'inhibition de la croissance les plus élevées contre l'isolat F42, sur les deux membranes avec 56,87% sur membrane de cellulose et 51,22% sur membrane de cellophane, le potentiel antagoniste des isolats de Trichoderma testés in vitro montre que leur capacité antagoniste dépend des isolats phytopathogènes ciblés. De même, au cours du test de l'activité antifongique in vivo, l'isolât T8 a montré la plus importante réduction de l'incidence de la maladie avec 53,12% et 48,28% contre Forlc et l'isolat F42 (Fol) respectivement.
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    Etude de la diversité génétique de Fusarium oxysporum Schlenchtend : Fr. f. sp. ciceris (Padwik) Matuo & K. Sato, agent du flétrissement de pois chiche
    (2010-07-07) DEBBI, Ali
    Le Fusarium oxysporum f . sp. ciceris agent de flétrissement de pois chiche, montre une variabilité pathologique importante. Celle-ci est représentée par huit races physiologiques répartis à travers le monde. Différentes techniques d’analyse ont été utilisées afin d’estimer la diversité génétique de 11 isolats de F. o. c. obtenus de différentes régions de culture de pois chiche en Algérie, par des études pathologiques, moléculaires et compatibilité végétative. A titre de comparaison, nous avons inclus dans notre analyse 3 isolats appartenant à d’autres espèces du genre Fusarium pour les deux dernières analyses. L’étude pathologique basée sur l’inoculation artificielle de 6 cultivars de pois chiche, a montré une variabilité entre les isolats de F. o. c. testés, et a permis de distinguer les isolats O-10/02, O-10/01, K-93, I-99 et G-93 ayant provoqué le symptôme de flétrissement. Par ailleurs l’isolat O-10/02 s’est révélé le plus agressif, alors que les deux isolats O-04/02 et S-93 se sont montrés les moins agressifs. L’étude moléculaire basée sur l’RAPD en utilisant les 2 amorces OPF-10 et OPI-01, a également montré une variabilité remarquable. Cette technique a permis de différencier deux groupes d’isolats : le groupe comprenant les isolats SS-03, O-93 et S- 93, induit le symptôme de jaunissement. Le deuxième groupe renferme les deux isolats O-10/01 et G-93, ayant induit le symptôme de flétrissement. Ce résultat confirme dans une certaine mesure les résultats de l’étude pathologique. En revanche, l’étude de la compatibilité végétative n’a pas permis de mettre en évidence une quelconque compatibilité entre les isolats