Browsing by Author "RIDA, Soumeya"
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Item Génétique d’association sous stress hydrique chez le maïs(2023-01-31) RIDA, SoumeyaLa présente étude a été menée dans le cadre de l’amélioration du maïs face au stress hydrique, où l’objectif général était d’étudier la régulation génétique de la tolérance au stress hydrique chez le maïs lors de différents stades de son développement allant de la germination jusqu’à l’achèvement du cycle de la culture. L’objectif de la première partie de cette étude conduite dans une chambre de culture est la détection des régions génomiques et gènes candidats impliqués dans la réponse au stress hydrique pendant la germination et le développement des semis. Nous avons évalué 420 RILs avec leurs parents provenant d’une population multiparentale (MAGIC) avec un stress hydrique induit par le PEG à la germination et pendant le développement des semis. Une étude d’association à l’échelle du génome (GWAS) a été réalisée pour identifier les régions génomiques associées à la tolérance au stress hydrique. L’étude GWAS a identifié 16 et 28 SNPs significativement associés aux paramètres étudiés dans les conditions normales et de stress, respectivement. Parmi les SNPs détectés, deux SNPs avaient des associations significatives avec plusieurs paramètres avec des corrélations positives élevées, suggérant un contrôle génétique pléiotropique. D’autres SNPs étaient situés dans des régions qui abritaient des QTLs majeurs dans des études antérieures, et colocalisées avec des QTLs pour la tolérance au froid précédemment publiés pour cette population MAGIC. Les régions génomiques comprenaient plusieurs gènes candidats liés aux stress et au développement des plantes. Il s’agit notamment de nombreux gènes et de facteurs de transcription impliqués dans la germination, les caractéristiques des semis et la tolérance à la sécheresse. D’autre part, la GWAS réalisée lors de la deuxième partie conduite sur le terrain en évaluant 318 lignées pures issues d’un panel d’association, nous a permis d’identifier 91 et 114 SNPs significativement associés au rendement et aux paramètres corrélés (vigueur, floraison mâle et femelle, ASI, hauteur de la plante, surface foliaire, sénescence, longueur de l’épi, nombre de rangées par épi et poids de mille grains) dans les conditions normales et de stress hydrique, respectivement. Parmi ces SNPs, six étaient significativement associés avec la surface foliaire dans les deux conditions suggérant un contrôle génétique commun. Les différents SNPs détectés correspondaient à 62 et 89 QTLs dans les conditions normales et de stress hydrique, respectivement, où la majorité des QTLs étaient associés au rendement. Plusieurs QTLs étaient localisés dans des régions génomiques importantes impliquées dans la réponse à différents stress biotiques et abiotiques. Les analyses actuelles fournissent des informations et des outils pour des études ultérieures et des programmes de sélection pour améliorer la tolérance au stress hydrique.Item Multiplication in vitro d’une gamme de seize génotypes de pomme de terre (Solanum tuberosum L.) résistants au mildiou (Phytophthora infestans).(2017-10-10) RIDA, SoumeyaNotre travail a porté sur la multiplication in vitro de la pomme de terre (Solanum tuberosum L.) et la production de microtubercules et minitubercules à partir d’une gamme de génotypes résistants à l’agent pathogène phytophthora infestans. Pour cela, trois phases ont été réalisées à savoir, la micropropagation, la microtubérisartion et la minitubérisation. Ainsi, à partir d’un petit nombre de vitroplants, un plus grand nombre a été obtenu par élongation-fragmentation durant trois cycles de multiplication successifs. La moitié des vitroplants obtenus a subi une phase d’élongation dans le milieu MS solide sous une photopériode de 16 h, ainsi qu’une phase de microtubérisation en milieu solide dans l’obscurité totale. L’autre moitié a subi a été transférée sur un substrat et cultivée en chambre de culture pour induire une minitubérisation sous une photopériode de 12h. Les résultats obtenus montrent : 1- Que les génotypes ont une influence significative sur la croissance et le développement des vitroplants : le génotype R1 permet d’obtenir la longueur moyenne des tiges la plus élevée et le génotype R4 permet l’obtention d’un grand nombre de feuilles par vitroplant, 2- Que le taux des vitroplants tubérisés, le nombre de microtubercules/vitroplant, la taille et le poids frais moyen des microtubercules ainsi que le taux de microtubercules germés avant récolte les plus élevés ont été obtenus avec les génotypes R11, R7, R1R2, R9, R5, R1R4, R2R3R4 et R1R2R3R4, 3- Que les génotypes ont une influence sur le taux de reprise des vitroplants après leur transfert dans un substrat, et que les génotypes R5, R9, R11, R1R2R4, R1R3R4, R2R3R4, R1R2R3 et R1R2R3R4 ont permis d’avoir globalement le