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Etude du polymorphisme génétique chez l'orobanche de la fève: Orobanche crenata Forskall. en Algérie, par l'utilisation des marqueurs moléculaires RAPD et AFLP
(INA, 2005) AOUALI, Souhila
Orobanche crenata is an obligatory parasitic plant of broad bean and other leguminous cultures, and generates serious damages on these cultures. Molecular approach by the use of three techniques of marking: SDS-PAGE, RAPD and AFLP was privileged in this study. The principal objective of this work, is to determine the intraspecific level of diversity, among populations of O crenata collected in various geographical localities of the Mitidja in Algeria, and to highlight interspecific polymorphism between the three most widespread species of broomrape in Algeria, namely O crenata O ramosa and O aegyptiaca The second objective is to study the effectiveness of the two types of DNA markers, RAPDs and AFLPs, in the detection of interspecific and intraspecific genetic polymorphism. The electrophoresis of native proteins of broomrape's seeds in SDS-PAGE, generated a relatively similar electrophoretic profiles between the various analyzed ecotypes of O.crenata. The comparison between the latter and those of O.ramosa revealed an obvious and clear difference. The interspecific and intraspecific genetic polymorphism was highlighted through the use of the two techniques of DNA marking, the RAPD and the AFLP. On the whole, 144 RAPDs markers were identified among the six ecotypes of O.crenata and O.aegyptiaca through which we could distinguish the two sections to which the two species belong, namely the Tryonikon section for O.aegyptiaca and the Osproléon section for O.crenata. The DNA analysis by the use of AFLP also revealed a notable polymorphism between the various ecotypes tested. On the whole, 429 AFLP markers were generated with 3 combined primers. The AFLP produced a better resolution of the analyzed genomic profiles. This technique proved more precise and more sensitive than the RAPD in the detection of polymorphism between very close genotypes.
Essai de caractérisation de quelques isolats de Rhizobium nodulant le pois chiche (Cicer arietinum L.)
(INA, 2006-11-02) BENHALIMA-CHENINI, Mounira
L’étude de vingt deux (22) isolats de Rhizobium prélevés de nodules de pois chiche de plusieurs régions d’Algérie et de trois (03) souches de références, a été réalisée sur la base de leur comportement, dans le cadre d’une analyse de la diversité chez cette espèce. Nous avons utilisé les approches phénologique, sérologique, moléculaire et symbiotique pour la caractérisation de ces isolats. A partir des différents tests utilisés, une grande diversité de comportement des isolats du Rhizobium du pois chiche a été observée. Cependant, aucune différence n’est apparue de part leur origine géographique. Seuls les aspects symbiotiques et moléculaires nous ont permis de mettre en évidence des isolats intéressants (fixation d'azote atmosphérique et diversité génotypique intraspécifique).
Recherche de marqueurs biologiques et moléculaires (RAPD) pour l’etude de la diversité génétique d’ Uromyces viciae-fabae, agent de la rouille de la fève/ féverole.
(INA, 2007-02-08) AZIRI, Hocine
Cette étude a porté sur l’analyse de la diversité génétique d’ U vicae-fabae , agent causal de la rouille des fèves, par l’analyse de la diversité à trois niveaux. Au niveau morphologique et culturale, par la mensuration des urédospores et ensuite par l’étude du pouvoir germinatif et du pouvoir infectieux de ces urédospores, au niveau du pouvoir pathogène et enfin, au niveau moléculaire, par l’analyse génétique, utilisant les marqueurs RAPD. Les marqueurs morphologiques et culturaux n’ont révélé aucune différence significative entre les 11 isolats étudiés. Le test du pouvoir germinatif et du pouvoir infection a, par la même occasion, montré que la durée de viabilité et du pouvoir infectieux des urédospores serait de 4 mois à – 20 °c, 2 mois à 4 °c et de quelques jours à la température ambiante. Le test du pouvoir pathogène a montré une différence entre les 11 isolats et que ces isolats pourraient êtres classés en deux groupes constituant chacun une race physiologique. Les marqueurs RAPD ont permis de confirmer la diversité révélé par le test du pouvoir pathogène. Ces deux test ont également permis de faire un tri des isolats en fonction de leur origine géographique. Cependant, la tentative de corrélation entre ces deux tests a montré un faible niveau de corrélation.
Réponse physiologique de la fèverole (Vicia faba minor L.) au stress thermique
(INA, 2007-02-28) NOUAR, Samia
Ce modeste travail nous a permis d’étudier l’effet du stress thermique sur la réponse physiologique de la féverole variété GIZA 402 pendant ces trois stades phénologiques. L’activité réductrice d’acétylène s’est montrée très sensible aux amplitudes thermiques suite au mauvais fonctionnement de la nitrogénase avec un pic de forte activité à 20 et 25°C. A basses températures l’ANR est importante; alors qu’à températures croissantes elle diminue progressivement suite à la dénaturation de l’enzyme. La croissance de notre souche estimée par la lecture de sa densité optique à 620 nm s’est révélée relativement sensible à l’abaissement (18°C) et à l’élévation de la température d’incubation (37°C). L’effet du stress thermique sur l’accumulation de la proline, indicateur de stress et osmo-protéctant se traduit par une augmentation de sa concentration au niveau des feuilles à 2 et à 5°C au stade végétatif et floraison.
OPTIMISATION DES FACTEURS INFLUENCANT L'ISOLEMENT DE PROTOPLASTES DE POMME DE TERRE
(2007-06-03) KADRI, NADIA
Le présent travail a porté sur l’optimisation des facteurs qui influencent l’isolement de prpotoplastes issus de cals et de mésophyte foliaires de vitro plants de la pomme de terre. Malgré que la réaction de tous les type d’explants en présence de différentes balances hormonales ait été observée, l’intensité de la callogénèse varie en fonction du milieu et du type d’explants. Les meilleurs cals ont été obtenus avec les entre noeuds sur T3 (2.4D/BAP=2 Les mésophiles foliaires et les cals d’entre noeuds de vitro plants de la G1 présentent des exigences différentes en condition d’isolement de protoplastes. En effet, les concentrations optimales en agent osmotique et en enzyme de macération ne sont pas les même pour les deux source de protoplastes. De plus, le mésophile foliaire s’avère être la meilleure source puisqu’il donne des protoplaste plus stables La dernière étape de l’isolement de protoplastes est la purification de la suspension issue de mésophyle foliaire. Nous avons pu montrer que le gradient discontinu à deux couches de saccharose 19/30% donne une meilleure séparation de débris des protoplastes et donc un meilleur niveau de purification.
Caractérisation de la variabilité biologique et pathologique de Fusarium oxysporum f.sp albedinis (Killian et Maire) W. L. Gordonet essais de méthodes de lutte « in vitro »
(INA, 2008) KADRI, Yasser
La fusariose est une maladie qui présente une menace sérieuse pour le palmier dattier en Algérie .des prospections ont été effectuées dans différentes régions du sud ouest Algérien. Le Fusarium oxysporum f. sp. albedinis., champignon responsable de la maladie du bayoud a été isolé essentiellement de la wilaya d’Adrar. Les isolats étudies ont été identifies par test de pathogénicité et l’étude de la compatibilité végétative. Le résultat confirme les travaux antérieurs réalisés à l’INA El-Harrach. La souche de Trichoderma. harzianuma présenté une activité antagoniste importante L’huile essentiel d’ Ammoides verticillata ou nunkha a eu un effet un effet inhibiteur de la croissance mycélienne des isolats F.o.a.in vitro. L’extrait brut de Citrullus colocynthisainsi que des fractions saponosides et glucosides extraits à partir de graines de C colocynthisprésentent un effet inhibiteur de la croissance mycélienne des isolats F.o.a. in vitro.
Caractérisation morphologique et purification partielle des composés toxiques de Phyrenophora graminea Ito et Kurib
(INA, 2008) ZAAMOUM, Miyada
La strie foliaire ou la maladie striée de l’orge causée par Pyrenophora graminea est parmi les maladies les plus importantes qui affectent l’orge en Algérie. Ce présent travail a pour objectifs : l’étude de la variabilité de 18 isolats de Pyrenophora graminea provenant de différentes régions de culture d’orge en Algérie, en tenant compte des critères suivants : sporulation, caractères morphologiques et le pouvoir pathogène. Les composés toxiques partiellement purifiés de trois isolats de Pyrenophora graminea choisi selon leurs réactions lors du test du pouvoir pathogène ont été testés sur trois variétés d’orge. La spécificité des composés toxiques contenu dans le filtrat de culture de l’isolat le plus virulent a été également testée sur 4 espèces non hôtes. La sporulation, les caractères morphologiques (type de croissance et couleur des colonies, croissance mycélienne et mensuration des conidies) ainsi que le test du pouvoir pathogène a révélé une grande variabilité entre les 18 isolats. En outre, les trois variétés utilisées lors du test du pouvoir pathogène ont montré un niveau de résistance très différent. L’infiltration des filtrats de culture des trois isolats induit sur les feuilles des trois variétés des symptômes analogues à ceux observés chez des plantes infectées par le champignon. Cependant, l’extension des stries est en relation avec le degré de virulence de l’isolat et du niveau de résistance de la variété infiltrée. Les composés toxiques contenus dans les filtrats de culture de Pyrenophora graminea confirment leur spécificité à l’orge.
Régénération par embryogenèse somatique de vitroplants de palmier dattier (cultivars Deglet Nour et Akerbouch) en vue de la résistance contre le Bayoud
(INA, 2008-01-25) DJILLALI, Zakia
Les différentes phases de l’embryogenèse somatique du palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) chez deux cultivars Deglet Nour (DN) et Akerbouch (AK), ont été étudiées à partir d’explants de cœur de rejet. Pour l’induction de la callogenèse, nous avons testé deux milieux de culture : MS simple (Murachig et Skoog, 1962) et MS modifié (MS additionné de 170 mg/l de NaH2PO4, 100 mg/l de KH2PO4, et 350 mg/l de NH4NO3) et six balances hormonales 2,4-D/ BAP : 1/1, 10/1, 20/1, 50/1, 100/1 et 5/5. Pour le cultivar DN, l’initiation des cals était supérieure sur les milieux MS sans additifs, et ce quelque soit la concentration hormonale utilisée. Alors que chez le cultivar AK, les équilibres 1/1 et 5/5 en présence ou en l’absence d’additifs ont permis les meilleurs pourcentages de callogenèse. La texture des cals était essentiellement de nature granuleuse chez AK et de nature mixte chez DN. Le passage des cals en milieu liquide avec 1 mg/l de 2,4-D a conduit au développement d’un grand nombre d’embryons globuleux et bipolaires à partir des cals essentiellement initiés sur les milieux T1 et M1 (1/1) pour AK et sur les milieux M4 (50/1) pour DN. Aussi nous avons défini deux modes de conduite des suspensions cellulaires pour une induction rapide et efficace des embryons somatiques : le système batch et le système continu ouvert. Enfin nous avons préconisé un milieu de régénération composé de ½ des minéraux MS semi solide et sans hormones de croissance. L’addition de 0.1 mg/l d’ANA et de 0,05 mg/l de BAP a amélioré l’enracinement des pousses feuillées (56%) et a favorisé la mise en place de l’embryogenèse secondaire.
Recherche de maladies à phtoplasmes sur rosacées fruitières dans la région du centre Algérien
(INA, 2008-03-10) MATALLAH, Hafidha
Une étude a été entreprise dans le but de rechercher la présence de maladies à phytoplasmes pouvant toucher les rosacées fruitières du pays, cette dernière à porté sur deux points essentiels. - Le premier consiste en une recherche de symptômes rappelant des phytoplasmoses sur les rosacées fruitières dans les stations de l’Institut technique de l’arboriculture fruitière (ITAF), ainsi que dans quelques vergers privés. -Le second point concerne la détection des agents par utilisation de méthodes microscopiques et moléculaires.
Régénération par embryogenèse somatique de vitroplants de palmiers dattiers (variété Degla Beida) en vue de la résistance contre le Bayoud
(INA, 2008-11-08) BOUFIS, Nazim
Régénération par embryogenèse somatique de vitroplants de palmiers dattiers (Variété Degla Beida) en vue de la résistance contre le Bayoud. L’objectif du présent travail consiste à optimiser l’obtention de vitroplants de palmier dattier (var. Degla Beida) par la voie de l’embryogenèse somatique dans le cadre de la lutte contre la maladie du Bayoud. Le schéma conduisant à l’obtention de vitroplants structurés, en grand nombre, s’articule comme suit : Induction de la callogenèse à partir d’explants issus du sommet du coeur d’un rejet et multiplication des cals embryogènes sur milieux solides contenant de fortes concentrations en 2,4 -D combinées à de fortes doses de charbon actif. Multiplication des nodules sur milieux liquides sous agitation de composition minérale appropriée en présence de faibles concentrations en 2,4 -D. Initiation de l’embryogenèse somatique en milieu liquide agité dépourvu d’hormones de croissance et de composition minérale appropriée. Maturation et germination des proembryons sur milieu gélosé dépourvu d’hormones de croissance de composition minérale appropriée.
Recherche de marqueurs de la spécialisation parasitaire de Pyrenophora tritici-repentis (Died.) Drechs., agent de la tache bronzée sur blé dur (Triticum durum Desf.) et blé tendre (Triticum aestivum L.).
(2009-10-12) TIZIOUALOU, Ghazia
Pyrenophora tritici-repentis est l’agent causal de la maladie de la tache bronzée du blé, une maladie d’une grande importance économique. Le présent travail se propose d’étudier les marqueurs de la spécialisation parasitaire de P. tritici-repentis sur blé dur et blé tendre ; pour cela nous avons étudié la variabilité morphologique et culturale de 13 isolats collectés de différentes régions de l’Algérie ; déterminé leur race sur une gamme d’hôte différentielle ; étudier la spécialisation pathogénique sur des variétés locales ; ainsi que l’effet des filtrat de culture des deux types d’isolats virulents sur les variétés sensibles de blé dur et blé tendre. Les caractères culturaux n’ont pas révélé une variabilité qui différencie les isolats obtenus de blé dur de celles obtenus de blé tendre. Par contre, La croissance mycélienne journalière et la taille des conidies obtenue sur feuilles vertes de blé, semblent être des marqueurs de la spécialisation de P.tritici-repentis sur blé dur et blé tendre, du fait qu’ils nous ont permis de différencier les deux types d’isolats. L’agressivité et la virulence des isolats, sur la gamme différentielle, semblent aussi être un marqueur de cette spécialisation puisque nous constatons que les isolats de blé dur sont plus virulents que les isolats de blé tendre. Par ailleurs, il n’existe pas de spécialisation pathogénique sur les deux espèces de blé, du fait que toutes les deux ont présenté une sensibilité aux deux types d’isolats, et une même sévérité de maladie. Le dernier test sur les filtrats de cultures, nous montre que la période d’apparition des symptômes, après infiltration des filtrats de cultures bruts, peut être un marqueur de la spécialisation parasitaire du P.tritici-repentis sur les deux espèces de blé. Contrairement aux types des symptômes apparus, qui n’ont révélé aucune différence entre les deux types d’isolats du fait qu’ils peuvent reproduire les symptômes de la maladie chez l’espèce de blé tendre comme chez le blé dur, et inversement ; seulement le blé dur semble être plus sensible à ces derniers que le blé tendre.
Regénération in vitro de plants sains à partir d'Apex caulinaires d'olivier Olea europea L. var. Chemlal
(2010-02-18) Tabti, Dalila
Nos essais ont concerné le matériel adulte de l’olivier Olea europea L. var. Chemlal. Des apex caulinaires et axillaires, issus de plants mères atteinds de la maladie dite tuberculose de l’olivier, provoquée par la bactérie Pseudomonas syringae subsps. savastanoϊ, sont excisés et mis en culture sur le milieu de Murashige et Skoog 1962 (M.S) additionné de BAP à 1, 1.5 et 2 mg/l. Les apex axillaires sont prélevés des boutures médianes. Le taux de réactivité des bourgeons est plus élevé avec les concentrations de 1 et 2 mg/l de BAP soit respectivement 63.63 % et 73.64%. Le meilleur taux de développement des pousses est obtenu avec 1mg/l (71.42%). L’induction racinaire des pousses feuillées est réalisée sur le milieu MS/2 (dilué de moitié), additionné d’ANA (0.01mg/l). Après quatre semaines de culture, un enracinement de 80% a été obtenu.
Etude du BSMV virus de la mosaïque striée de l'orge
(2010-02-26) BOUBETRA, Souhila
Des prospections réalisées sur champs, dans les régions du centre et de l’est du nord de l’Algérie, ont mis en évidence la présence du Barley Stripe Mosaic Virus (BSMV) sur deux variétés de blé dur (Belliouni 3848 et GTA dur), une variété de blé tendre (Hiddab) et une variété d’orge (Rihane). Par ailleurs, une analyse phytosanitaire sur des lots de semences a été réalisée, et a révélé la présence de ce même virus sur deux variétés de blé dur (Chen’s et Belliouni 3848), une variété de blé tendre (HD1220) et deux variétés d’orge (Rihane et Saïda). L’étude du pouvoir pathogène du BSMV sur plants d’orge inoculés et non inoculés de la variété Acsad60 et Saïda a permis de noté deux types de symptômes (Petites stries blanchâtres et stries courtes jaunâtres). Le test ACP-ELISA appliqué pour ces derniers confirme que les deux symptômes relevés sont réellement induits par le BSMV. L’étude du taux de transmission par semence du BSMV sur les jeunes semis issus de semence de plants inoculés et de plants non inoculés, des deux variétés d’orge a montré par le test TBIA que ces taux de transmission étaient plus élevé chez la variété Saida pour les deux essais (66% inoculé et 73,8% non inoculé) .Par contre l’analyse par groupe utilisant la DAS-ELISA a démontré que pour ces deux variétés le taux de transmission est comparativement très faible, variant de 0 à 2,05 %
Recherche sur l'état sanitaire des semences de céréales et de légumineuses alimentaires
(2010-03-01) BOUNAR, Rekia
Les céréales et les légumineuses alimentaires occupent une place importante en Algérie de part leur diversité ainsi que l’intérêt nutritionnel et agronomique. Aussi comme beaucoup de produits agricoles, ils sont le siège d’une riche mycoflore fongique qui peut se développer aussi bien en plein champ qu’au cours du stockage. L’incidence d’une telle population biologique sur la qualité de conservation de ces produits devient une problématique aussi bien pour leur valeur nutritionnelle que le maintien de leur valeur germinative. Parmi la flore qui se développe, certains champignons tels que Fusarium, Aspergillus et Penicillium sont des producteurs potentiels de mycotoxines et dont certaines sont très dangereuses pour la santé humaine et / ou animale (Aflatoxine, Ochratoxine, Fumonisine, Trichothécène, Zearalénone etc.…). En Algérie, ces substances toxiques ont fait l’objet de peu d’études et de ce fait nos connaissances restent encore très limitées. . L’objectif de ce présent travail est donc d'évaluer la qualité phytosanitaire de semences des céréales et des légumineuses alimentaires quant à leur contamination éventuelle en mycoflore et en mycotoxines. Les résultats de l’analyse de la flore fongique de quelques espèces de céréales (Blé dur, Blé tendre et Orge) et de légumineuses (Fève, Pois chiche et Arachides) ont montré une mycoflore abondante et diversifiée à savoir une mycoflore pathogène, une mycoflore intermédiaire et une mycoflore de stockage. L’inventaire réalisé et le calcul de la fréquence et de l’abondance de chaque agent ongique ont révélé que dans tous lots confondus hormis les arachides, les espèces d’Alternaria sont les plus dominants. La présence d’Aspergillus flavus et A. parasiticus était importante dans les échantillons d’arachides. La répartition des agents fongiques isolés dans toute les parties de la graine fait apparaitre une certaine hétérogénéité de contamination , les taux les plus élevés , se trouvent dans les enveloppes externes et diminuent de plus en plus en allant vers l’intérieur de la graine (embryon). L’analyse statistique de l’effet de la mycoflore sur la germination n’a montré aucune corrélation entre le pourcentage de contamination et celui de la germination, l’impact des agents fongiques sur l’état sanitaire de la graine dépend de leur site d’infection. . Les analyses chimiques concernant les mycotoxines ont montré que parmi ce cortège floristique, seules deux espèces du genre Aspergillus isolées des grains d’arachides se sont montré potentiellement toxinogènes à savoir Aspergillus flavus et A. parasiticus. Le pouvoir aflatoxinogènes des 28 isolats obtenus a été évalué par la CCM et par le spectrophotomètre, les quantités d’aflatoxines varies de 28,58 à 99,83 mg / 50 ml. La purification par CCM et la quantification par HPLC de l’aflatoxine extraite des grains d’arachides a montré que le taux d’aflatoxine dans ces derniers varie de 0,29 à 3,1 ng / g L’étude sur la phytotoxicité des grains traités par le filtrat de culture a révélé une inhibition significative de la germination des grains de végétaux. . Le test d’aflatoxine comme herbicide naturel a induit un effet inhibiteur des grains des plantes parasites, le taux d’inhibition est proportionnel aux concentrations utilisées.
Mise au point d'une technique moléculaire de détection de Xanthomonas campestris et validation d'une procédure de détection dans les semences basée sur la PCR
(2010-03-11) LAALA, Samia
Xanthomonas campestris provoque des maladies chez les plantes de la famille des Brassicacées. L’une de ces maladies est la nervation noire. Elle est de distribution universelle et considérée comme la plus destructive des crucifères. Bien que les sources de contamination soient multiples, la semence reste la source principale de la transmission des pathogènes. S’assurer de leur qualité sanitaire est le moyen de lutte le plus efficace contre les bactérioses. Actuellement les techniques officielles adoptées dans les procédures de contrôle des lots de semences sont essentiellement basées sur les techniques microbiologiques. Ces techniques sont longues et coûteuses pour être utilisés en routine. La PCR utilise comme substrat l’ADN qui est une molécule stable, ne rend pas compte de la viabilité des bactéries dans l’échantillon analysé. Le présent travail avait comme objectif de proposer un nouvel outil moléculaire de détection fiable et rapide de Xanthomonas campestris vivant dans les semences de chou. Trois méthodes moléculaires ont été étudiées et testés afin d’évaluer leur potentiel de détection de Xanthomonas campestris dans les semences. La première technique qui a été développée durant cette étude est la RT-PCR. Elle utilise l’ARN comme matrice et permet d’amplifier l’ADNc à partir de l’ARNm cible grâce à une transcription inverse. Des amorces ont été sélectionnés dans quatre gènes rpoD, gyrB, galA et XCC2585, leur seuil de sensibilité et leur potentiel de spécificité ont été testés et comparées.Cette technique a permis de détecter les transcris de deux gènes parmi les quatre gènes candidats testés. Ils’agit du gène rpoD et gyrB. Le gène galA et XCC2585 ne s’exprime pas de manière constitutive. La deuxième partie de notre travail était de valider la méthode BIO-PCR sur des lots de semences naturellement infectées par X. campstris. Cette technique a permis de détecter jusqu'à 10cfu/ml de macérât de semence. La troisième technique que nous avons mise au point pour la détection de X. campestris vivants dans les lots de semences est la SEED-PCR. Cette technique est basée sur un enrichissement par germination des semences contaminées couplée à une Taq-man PCR en temps réel après extraction de l’ADN cible. C’est une technique peu onéreuse et permet de détecter jusqu’au 1 graine contaminée parmi 10 000 graines saines, meme quand la graine est contaminée a un faible niveau.
Contribution à l’étude de la tristeza des agrumes (CTV) : Caractérisation biologique et mise au point de méthodes de lutte.
(2010-04-11) KHEDDAM, Hocine
La tristeza est la maladie virale la plus importante des agrumes dans le monde entier. Notre contribution a porté sur la localisation des sites prés de la zone de quarantaine, sur la base d’un diagnostic symptômatologique, le symptôme le plus dominant dans nos vergers est le dépérissement. Sur les 4 sites prospectés, 3 sont contaminés par cette affection à des taux d’infection qui varient de 24 à 76%. L’identification réalisée à permis de montré la présence du CTV dans différents vergers avec un taux d’infection de 39%, mais les résultats de L’indexage a montré que l’isolat Algérien du CTV est peu pathogène Parmi les techniques utilisées dans l’assainissement, la thermothérapie et le micro- greffage de l’apex ont une grande efficacité pour éliminer les maladies virales telles que le CTV comme l’ont montré nos résultats qui classent le traitement 3 (la combinaison des deux méthodes) en premier par un pourcentage d’efficacité suivi par le traitement 2 (thermothérapie) et en dernier le traitement 1 (microgreffage).
Etude de la diversité génétique de Fusarium oxysporum Schlenchtend : Fr. f. sp. ciceris (Padwik) Matuo & K. Sato, agent du flétrissement de pois chiche
(2010-07-07) DEBBI, Ali
Le Fusarium oxysporum f . sp. ciceris agent de flétrissement de pois chiche, montre une variabilité pathologique importante. Celle-ci est représentée par huit races physiologiques répartis à travers le monde. Différentes techniques d’analyse ont été utilisées afin d’estimer la diversité génétique de 11 isolats de F. o. c. obtenus de différentes régions de culture de pois chiche en Algérie, par des études pathologiques, moléculaires et compatibilité végétative. A titre de comparaison, nous avons inclus dans notre analyse 3 isolats appartenant à d’autres espèces du genre Fusarium pour les deux dernières analyses. L’étude pathologique basée sur l’inoculation artificielle de 6 cultivars de pois chiche, a montré une variabilité entre les isolats de F. o. c. testés, et a permis de distinguer les isolats O-10/02, O-10/01, K-93, I-99 et G-93 ayant provoqué le symptôme de flétrissement. Par ailleurs l’isolat O-10/02 s’est révélé le plus agressif, alors que les deux isolats O-04/02 et S-93 se sont montrés les moins agressifs. L’étude moléculaire basée sur l’RAPD en utilisant les 2 amorces OPF-10 et OPI-01, a également montré une variabilité remarquable. Cette technique a permis de différencier deux groupes d’isolats : le groupe comprenant les isolats SS-03, O-93 et S- 93, induit le symptôme de jaunissement. Le deuxième groupe renferme les deux isolats O-10/01 et G-93, ayant induit le symptôme de flétrissement. Ce résultat confirme dans une certaine mesure les résultats de l’étude pathologique. En revanche, l’étude de la compatibilité végétative n’a pas permis de mettre en évidence une quelconque compatibilité entre les isolats
Etude histologique de la pénétration de Fusarium oxysporum f. sp. albedinis (Hansen et Snyder) Gordon à travers les racines de palmier dattier (Phoenix dactylifera L.)
(2010-07-12) BOUDEFFEUR, Saïd
Le développement du palmier dattier, dépend de la levée de plusieurs contraintes entre autres, la maladie du Bayoud causée par un champignon tellurique appelé Fusarium oxysporum f.sp.albedinis. Dans le cadre de ce travail, nous avons étudié le mode de la colonisation et le suivi de l'infection des jeunes racines de trois variétés (TEGAZA, TINASSER et TAKERBOUCHT) respectivement sensible, tolérante et résistante. Des coupes histologiques ont été pratiquées sur les jeunes racines préalablement inoculées et infectées, un mois après l'inoculation artificielle des jeunes plantules au stade de 2 feuilles. Ces dernières ont été placées dans des petits flacons, puis subi des bains de KOH à 10%. Les coupes histologiques transversales réalisées sur les jeunes racines infectées des trois variétés ont montré deux zones bien distinctes : l'écorce et le cylindre central. Les racines des variétés suivantes, TEGAZA et TINASSER (variétés sensible et tolérante) ont révélé une couleur brune rougeâtre avec la présence de filaments mycéliens à la surface et la formation d'invaginations ou cryptes. L'installation du parasite au niveau des cellules racinaires commence par l’écorce, puis atteint le cylindre central. Le parasite se propage ensuite dans le xylème et cause son obstruction en bloquant ainsi le flux de sève. Les apex racinaires de TAKERBOUCHT (variété résistante) ont montré dans certains cas un brunissement localisé et la progression du F.o.albedinis reste très limitée au point d’infection. Aucune présence du champignon dans le xylème ni dans le cylindre central n’a été observée. Le mycélium du F.o.albedinis n’a pas pu s'insinuer dans les tissus racinaires de la TAKERBOUCHT au-delà d’une certaine limite. Des invaginations fongiques se sont formées suite à la pression exercée par les appressoria, pour faciliter la pénétration du mycélium. Une production intense de polyphénols notamment au niveau du sclérenchyme des différentes variétés a été observée. La variété TAKERBOUCHT semble plus productive de polyphénols qui interviendraient dans la résistance totale à la fusariose du dattier.
Etude de la spécialisation parasitaire et de la diversité génétique d'une collection d'isolats de Botrytis spp.
(2010-07-14) MEAMICHE, Hayet
Le genre Botrytis est composé d’espèces phytopathogènes redoutables qui s’attaquent à de nombreuses cultures dans le monde. L’espèce polyphage Botrytis cinerea présente une gamme d’hôtes de plus de 235 plantes. La lutte chimique est la plus utilisée, cela dit, de nombreuses classes de fongicides deviennent inefficaces en raison de la variabilité phénotypique et génétique du pathogène. L’identification des espèces de Botrytis et la connaissance des mécanismes régissant la spécialisation parasitaire et les interactions hôte-pathogène sont nécessaires pour améliorer les techniques de lutte. Afin d’y parvenir, 3 axes sont développés dans ce travail :Le premier vise à identifier les espèces d’une collection de Botrytis spp. provenant de différentes plantes hôtes. L’étude des critères morphologiques à travers l’aspect des colonies, la taille des spores et leurs concentrations, les sclérotes et leurs densités à permis d’identifier 19 isolats appartenant à l’espèce polyphage Botrytis cinerea et 1 isolats supposé appartenir à une espèce spécialisée associée à Allium spp. Ces critères macroscopiques et microscopiques indiquent qu’il s’agit de l’espèce Botrytis alcada. Le second axe concerne l’étude de la spécialisation parasitaire et du pouvoir pathogène de la collection de Botrytis spp. Une technique d’inoculation artificielle sur des feuilles détachées a été mise au point. Les mesures des périodes d’incubation, de latence, du nombre de spores et des valeurs AUDPC ont permis d’observer une variabilité importante du pouvoir pathogène des isolats ainsi que l’extrême polyphagie de l’espèce Botrytis cinerea. La spécialisation parasitaire de l’isolat BOA01 a été confirmée. Le troisième axe vise l’étude de la diversité génétique de la collection de Botrytis spp. par l’analyse du polymorphispme des profils RAPD. L’étude a confirmé l’appartenance des 19 isolats à l’espèce Botrytis cinerea et a classé l’isolat BOA01 comme un isolat distinct des autres. L’analyse a révélé que les isolats peuvent présenter profils similaires indépendamment de leurs origines géographiques et de la plante hôte. Les résultats obtenus soulignent l’intérêt d’utiliser d’avantage de marqueurs moléculaires pour estimer la diversité génétique des populations de Botrytis en Algérie.
Nutrition azotée sous déficience en phosphore chez le niébé (vigna unguiculata Sub. Sp unguiculata L. Walp)
(2011-01-20) BENAGGAB-AMAR, Radhia
Le présent travail à porté sur l’évaluation de l’activité solubilitrice des phosphates naturels chez quatre rhizobiums isolés des nodules de vigna, cette étude a été conduite en premier temps in vitro pour identifier les bactéries solubilisant les phosphates. Les deux isolats R3 et R6 ont révélé une activité solubilisatrice très nette, et d’une diminution plus marqué du pH du milieu de culture. En deuxième temps, nous avons étudié la combinaison des isolats R1, R3, R5 et R6 avec la roche phosphatée, pour évaluer leurs effets sur les paramètres de croissance, les propriétés symbiotique, le rendement et ses composantes, et le contenu en éléments minéraux. L’isolat R1 a donné un nombre de nodules significativement plus élevé, ainsi que le rendement par rapport au reste des isolats. L’effet de l’inoculation est positif pour tous les paramètres mesurés. Par contre l’effet de l’inoculation est négatif concernant le contenu des feuilles en phosphore total.

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